Análisis de ecología y biodiversidad

Estadística de ecología y biodiversidad que conecta patrones de comunidad a preguntas ecológicas.

Análisis para datasets ecológicos, ambientales, de microbioma y biodiversidad, con énfasis en estructura multivariada, métricas de diversidad, ordenación e interpretación clara de resultados ecológicos.

Datos ecológicos

De tablas de especies a patrones de comunidad interpretables

Los datasets ecológicos suelen combinar muchos taxones, variables ambientales, grupos y factores de muestreo. El análisis necesita respetar esa estructura.

Diversidad alfa
Riqueza observada, Chao1, Shannon, Simpson e índices relacionados cuando corresponda.
Diversidad beta y composición de comunidad
Enfoques basados en distancia para comparar estructura multivariada de comunidades.
Ordenación
NMDS, PCA, RDA y enfoques relacionados para visualizar y explicar patrones multivariados.
Factores ambientales
Relacionar patrones de comunidad con suelo, clima, hábitat, manejo u otras variables medidas.
Métodos comunes

Caja de herramientas de ecología y biodiversidad

NMDSPERMANOVARDAPCADiversidad alfaDiversidad betaBray-CurtisAnálisis de clústerAnálisis de comunidadGradientes ambientales
Cómo funciona la interpretación

Un p-valor significativo no cuenta toda la historia ecológica

Un análisis útil conecta la evidencia estadística con el tamaño de efecto, la variación explicada, la estructura de comunidad, el diseño del estudio y el significado ecológico.

La pregunta primero

Definir qué difiere, qué predice qué, y qué componente de la estructura de comunidad se está probando realmente.

Distancia y diseño

Elegir una disimilitud apropiada y considerar el diseño de muestreo en vez de tratar cada observación como independiente por defecto.

Interpretación

Reportar el resultado estadístico junto con la información necesaria para entender la magnitud y estructura del patrón.

Flujo de trabajo

Flujo típico de análisis ecológico

1

Auditar la tabla de comunidad y metadatos

Revisar identificadores de muestra, estructura taxonómica o de features, variables ambientales, datos faltantes y factores de agrupación.

2

Definir preguntas de diversidad y multivariadas

Elegir métricas y enfoques de ordenación o prueba de hipótesis que correspondan a la pregunta biológica.

3

Correr, diagnosticar, visualizar, explicar

Producir figuras listas para publicación y explicar qué respalda el análisis, y qué no.

¿Trabajando con un dataset de ecología?

Envía la pregunta de investigación, una muestra de los datos o metadatos, y cualquier análisis ya intentado. El primer paso es determinar el alcance analítico correcto.

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