Análise de ecologia e biodiversidade

Estatística de ecologia e biodiversidade que conecta padrões de comunidade a perguntas ecológicas.

Análise para dados ecológicos, ambientais, de microbioma e biodiversidade, com ênfase em estrutura multivariada, métricas de diversidade, ordenação e interpretação clara dos resultados ecológicos.

Dados ecológicos

De tabelas de espécies a padrões de comunidade interpretáveis

Datasets ecológicos costumam combinar muitos táxons, variáveis ambientais, grupos e fatores amostrais. A análise precisa respeitar essa estrutura.

Diversidade alfa
Riqueza observada, Chao1, Shannon, Simpson e índices relacionados quando apropriado.
Diversidade beta e composição de comunidade
Abordagens baseadas em distância pra comparar estrutura multivariada de comunidades.
Ordenação
NMDS, PCA, RDA e abordagens relacionadas pra visualizar e explicar padrões multivariados.
Fatores ambientais
Relacionar padrões de comunidade com solo, clima, habitat, manejo ou outras variáveis medidas.
Métodos comuns

Caixa de ferramentas de ecologia e biodiversidade

NMDSPERMANOVARDAPCADiversidade alfaDiversidade betaBray-CurtisAnálise de clusterAnálise de comunidadeGradientes ambientais
Como funciona a interpretação

Um p-valor significativo não conta a história ecológica inteira

Uma análise útil conecta a evidência estatística com tamanho de efeito, variação explicada, estrutura de comunidade, delineamento do estudo e significado ecológico.

Pergunta primeiro

Definir o que difere, o que prevê o quê, e qual componente da estrutura de comunidade está sendo testado de fato.

Distância e delineamento

Escolher uma dissimilaridade apropriada e considerar o delineamento amostral em vez de tratar cada observação como independente por padrão.

Interpretação

Reportar o resultado estatístico junto com a informação necessária pra entender a magnitude e a estrutura do padrão.

Fluxo de trabalho

Fluxo típico de análise ecológica

1

Auditar a tabela de comunidade e metadados

Checar identificadores de amostra, estrutura taxonômica ou de feature, variáveis ambientais, dados faltantes e fatores de agrupamento.

2

Definir perguntas de diversidade e multivariadas

Escolher métricas e abordagens de ordenação ou teste de hipótese que correspondam à pergunta biológica.

3

Rodar, diagnosticar, visualizar, explicar

Produzir figuras prontas pra publicação e explicar o que a análise sustenta, e o que não sustenta.

Trabalhando com um dataset de ecologia?

Manda a pergunta de pesquisa, uma amostra dos dados ou metadados, e qualquer análise já tentada. O primeiro passo é determinar o escopo analítico certo.

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